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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

北美领导人峰会在墨西哥举行 美加墨发表联合声明******

　　当地时间1月10日17时，美国总统拜登、加拿大总理特鲁多和墨西哥总统洛佩斯在墨西哥城国家宫举行北美领导人峰会的新闻招待会，并在会后发布联合声明。

　　美国总统拜登在声明中表示，目前北美地区以及全世界所面临的问题已经不能通过隔断各国之间的关联来解决。同时，他还在声明中提及了毒品和非法移民问题。

　　对此，墨西哥总统洛佩斯表示，墨西哥作为安全第三国，将接收从美国遣返的中南美洲移民，他强调来自中南美洲的移民是迫于无奈，在生活压力下才选择前往美国，包括美国在内的各方应当尽可能妥善解决移民问题。

　　加拿大总理提及了北美三国之间的产业链整合，供应链一体化的问题。特鲁多强调，在发展更有弹性的供应链方面，加拿大是一个非常重要的合作伙伴。

　　按照计划，美国总统拜登将在当地时间10日晚间离开墨西哥返回美国，而加拿大总理特鲁多将于当地时间11日下午离开墨西哥返回加拿大。(总台记者 盛嘉迪 吕兴林 张颖哲)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）